3月9日消息,亞馬遜云科技宣布近期與加拿大不列顛哥倫比亞大學云創新中心(UBC CIC)達成合作,基于亞馬遜云科技構建的超級計算平臺,助力國際科學家團隊在短短11天內搜索了近600萬份公開可用的生物樣本,成功識別出超過13萬種新的RNA病毒,其中包括9種新型冠狀病毒。
在亞馬遜云科技助力下,UBC CIC團隊和全球計算病毒學家啟動了The Open Virome(開放病毒組)項目,創建了開放的病毒發現云計算平臺Serratus。目前,該研究成果已經發表在科學雜志《自然》上,同時還創建了公開的病毒數據庫,向全球科學界分享研究成果,幫助加速對RNA病毒的研究。
據介紹,The Open Virome項目的研究人員僅用8周時間,順利地在亞馬遜云科技上構建超級計算平臺。借助亞馬遜云科技卓越的彈性計算能力,他們能夠快速處理數百萬GB的數據,并且獲得了顯著的成本效益。該團隊在亞馬遜云科技Amazon Simple Storage Service(Amazon S3)中鏡像了病毒基因測序數據庫SRA,之后使用亞馬遜云科技彈性計算云實例Amazon Elastic Compute Cloud (Amazon EC2)來分析數據集。
最終,在11天內,該團隊就處理了高達570萬個測序數據集,僅花費了2.4萬美元,發現了13萬個新的RNA病毒。在此之前,科學家們經過幾十年的數據分析,只發現了1.5萬種病毒。The Open Virome項目團隊使用亞馬遜云科技的基礎架構和服務后,在發現新病毒方面已經為科學界節省了數百萬美元和長達數年的時間。
另外,通過基于亞馬遜云科技搭建的Serratus平臺,研究人員相信他們既能識別潛在的有害新病毒,又能提醒科學家注意導致新冠肺炎病毒SARS-CoV-2 virus的潛在突變,幫助改善診斷測試和疫苗開發,為醫療政策決策者提供更有效的指導。
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