美國國立衛生研究院(NIH)希望將新興技術轉化為有用的數據集,重點關注人體數萬億個細胞是如何相互連接和相互作用的。研究人員在最新一期《自然》雜志撰文稱,在NIH的方針指引下,他們計劃開展“人類生物分子圖譜計劃”(HuBMAP),以描述人體主要器官中每個細胞的生物化學環境以及位置。
HuBMAP項目負責人之一、普渡大學分析化學家茱莉亞⋅拉斯金說,這一項目旨在“建立構成健康系統的基準”,讓研究人員能夠借此找到導致疾病的原因。
直到最近,生物醫學家們才大致了解器官的功能。尤其重要的是,他們成功掌握了特定組織中的基因的活性,能夠打開和關閉它們。基因活性定義了細胞的功能。但器官由多種細胞組成,每種細胞都有自己的分子特征。
2016年,利用研究單個細胞的技術,“人類細胞圖譜”(HCA)項目啟動,希望對細胞在不同身體組織中的運作方式進行分類。目前有來自65個國家(地區)的1500名科學家參與了該項目,并獲得了歐盟“地平線2020”等項目的支持。
斯坦福大學基因組學家米歇爾⋅施耐德解釋說:“希望HuBMAP能在領導和建立框架中發揮重要作用,這將有助于將HCA與其他十幾個項目結合起來,對特定器官(例如腦、肺、腎和腫瘤前體)內的單個細胞進行分析。而且,在對不同項目進行融合時,還涉及建立通用標準、協議和呈現數據的方式。”
據美國《科學》雜志官網報道,NIH計劃在未來8年內向HuBMAP投資2億美元,該機構目前已向約120名研究人員提供了5400萬美元的資助。一個小組將研究細胞本身:除了確定基因活性并使用其他組學方法外,他們還將使用熒光顯微鏡和成像方法收集有關蛋白質、DNA修飾、脂質、RNA和其他關鍵分子的空間信息,以構建細胞的三維圖譜;第二組研究人員將開發呈現這些數據并允許研究人員瀏覽圖集所需的計算機工具;而包括拉斯金在內的第三組正在開發研究這些細胞的更好的技術。(記者劉霞)
關鍵詞: